• 2000年7月8日【70分】東宝
• 監督：湯山邦彦
• 脚本：首藤剛志、園田英樹
• 撮影：白井久男
• 音楽：宮崎慎二
• 美術：金村勝義、高橋和博
• 出演：松本梨香、大谷育江、飯塚雅弓、上田祐司、こおろぎさとみ　他多数

【解説】
孤独な少女の心が生み出したポケモンを巡って、お馴染みポケモンマスターを目指す少年たちが繰り広げる冒険を描いた長編ジュブナイル・アニメーションの第3作。田尻智による原案を基に、『劇場版ポケットモンスター　幻のポケモン　ルギア爆誕』の首藤剛志と『ピチュウとピカチュウ』の園田英樹が共同で脚本を執筆。

【あらすじ】
両親を亡くし、ひとり淋しく大きな館に暮らしている少女・ミーは、ある夜、考古学者だった父親のシュリー博士が残した奇妙な文字カードを並べていて、人の気持ちに反応し様々な事象を巻き起こす謎のポケモン、アンノーンを古代遺跡から蘇らせる。ミーの寂しい心に反応して、彼女の住むグリーンフィールドという街を結晶で覆うアンノーン。更にそれは、ミーの父親代わりに幻のポケモン、エンテイを呼び出すのであった。そして、エンテイは父親としてミーの母親が欲しいという願いを叶える為、サトシのママをさらってしまう…。