• 2002年7月13日【75分】東宝
• 監督：湯山邦彦
• 脚本：園田英樹
• 原案：田尻智
• 撮影：白井久男
• 音楽：ｃｏｂａ、宮崎慎二
• 美術：金村勝義
• 出演：松本梨香、大谷育江、飯塚雅弓、上田祐司、林原めぐみ　他多数

【解説】
水の都を舞台に、ポケモンマスターを目指すサトシとその相棒・ピカチュウが繰り広げる冒険を描いた長篇アニメーションのシリーズ第5作。監督は「PIKACHU THE MOVIE 2001　ピカチュウのドキドキかくれんぼ」の湯山邦彦。田尻智による原案を基に、「劇場版 ポケットモンスター　セレビィ 時を超えた遭遇」の園田英樹が脚本を執筆。

【あらすじ】
世界で一番美しい町といわれる水の都“アルトマーレ”。ここでサトシとピカチュウは、不思議な技を持つ兄妹ポケモン＜ラティアス＞＜ラティオス＞と出会う。兄妹は二人でこの町のどこかに隠されている秘宝“心のしずく”を人知れず守っていた。しかし、世界的に名の知れたセクシー姉妹怪盗ザンナーとリオンがこの秘宝を狙って町にやって来た。姉妹は町で事件を引き起こし、サトシとピカチュウたちはこれに巻き込まれてしまう。そして、“心のしずく”とアルトマーレに隠された封印が解かれたことにより、町は大水害に見舞われてしまうのだった…。